Ja sam imao sličan problem, ja sam htio da instaliram cPanel na server koji je bio bez control panel-a.
Kontaktirao sam tehničku podršku, i oni su mi rekli da nije problem to da se odradi ali da ću ja morati da svučem backup servera na moj računar, da ću posle ja morati da ga uploadujem itd itd, generalno, isto kao i tebi.
Nakon toga, ja sam ih pitao dal' postoji bezbolniji i brži način da se to odradi a oni su mi rekli da mogu oni to da odrade.
Generalno, oni su pristali kao da uzmu novi hard disk, tj ja bi trebao da ga iznajmim, da oni kopiraju i vrate podatke itd itd.
Sve u svemu, cijena je ispala prilično visoka za uslugu backupa, reinstalacije OS-a, instalacije cPanela i restore backupa.

Ja ti predlažem da ih kontaktiraš ponovo, i da vidiš dal' postoji mogućnost da ti oni odrade backup/restore, al očekuj da će cijena da bude prilično visoka.

P.S. Kontrolni panel se baš integriše u operativni sistem, i da bi ga instalirao, generalno je potrebna "čista" instalacija istog. Podatke ćeš, naravno, reinstalacijom sistema izgubiti, al zato postoji mogućnost koju sam predhodno naveo - a to je backup & restore.

Pozdrav.