Ovo kako si opisao djeluje kao neki problem sa skriptama u admin/ direktorijumu i nema mnogo veze sa apache-om.

Na server sam stavio i mediawiki i kada pokusam da pokrenem tako sto u browser ukucam http://localhost/mediawiki/config/index.php desi mi se ista stvar.

Otvori /var/www i vidi ima li index.html fajl. Ako postoji izmjeni ga (dodaj neki tekst) i ponovo upisi www.mvc.com i pogledaj da li se vidi ta promjena.
Ako se vidi pogledaj postoji li folder /var/www/admin. Ako ne postoji, znas u cemu je problem :)
Po defaultu je /var/www root folder za server....

Ja nemam taj folder www unutar /var -a.
Ono sto mi je cudno je da kad u browseru ukucam localhost trebalo bi da mi se prikaze stranica index.html koja se nalazi u direktorijumu apache/htdocs direktorijuma a on mi pokrece
neku drugu stranicu.Gde mogu da vidim koji je localhost direktorijum za server

/etc/apache2/apache2.conf
Pa nađi DocumentRoot

Ili, elegantnije: