Ja to radim tako sto najobicnij ASCII fajl kriptujem. Mislim da mi je to najsigurnije resenje, ako izuzmemo papir i olovku pa u sef.

Ja sam sifre uneo u word dokument onda izabrao sledeci Encryption type:
RC4, Microsoft RSA SChannel Cryptographic Provider, 128bit kljuc i uneo jaku lozinku i to je to.

KeePass Password Safe
http://keepass.sourceforge.net


http://ghosthunter.true.ws

Nema potrebe za nekom posebnom aplikacijom, običan tekstualni fajl (ili nekakva XML strukturica) + http://www.gnupg.org/ za njegovo kriptovanje i sve je na svom mestu...