.jad ti nastaje dekompajlirajem .class fajla. Dovoljno je preimenovanje u .java i imaš source.
A .jar je arhiva nalik na .zip. Može da se pokrene pomoću
ako u svom sadržaju ima manifest fajl koji pokazuje na klasu čija main(...) metoda se izvršava ili sa
gde je Klasa ime one klase čija main metoda se pokreće.

U .jar fajlu možda i nema nijedna klasa sa main metodom, a tada arhiva služi kao dopuna classpathu (kroz komandnu liniju, ili na druge načine).
Za više detalja pogledati literaturu.

znam o cemu se radi - to je java program koji se izvrsava na mobilnim
telefonima ali treba mi neki emulator za pc koji ce pokrenuti taj program

Sa Sun-ovog sajta skines J2ME WTK razvojno okruzenje za mobilne uredjaje (oko 12mb) i u okviru njega imas i emulator. Posle instalacije samo kliknes na .jad fajl i aplikacija se startuje :)
Takodje pogledaj na sajtove proizvodjaca mobilnih telefona i tu mozas skinuti emulatore tacno odredjenih telefona (Nokia i Siemens imju ovu mogucnost, za ostale ne znam).