Za kernel ne znam, ali sto se tice bootovanja u /etc imas datoteku inittab u njoj treba da promenis runlevel i tu mozes da postavis sta zelis da se pokrene.

Da bi kompajlirao kernel, prvo moraš imati raspakovan kernel-source u nekom direktorijumu, npr /usr/src/linux. Onda se loguješ kao root i kucaš

cd /usr/src/linux
make mrproper
make xconfig

Onda treba da podesiš koje module treba kompajlirati statički, a koje dinamički. Ako radiš bez X-a, umesto xconfig kucaj menuconfig.

make dep
make clean
make bzImage
make modules
make modules_install
make install