Grubo rečeno, program igra policajca koji zaustavlja svaku sistemsku operaciju nad nekim direktorijumom, proverava da li je "dozvoljena" i na osnovu toga je pušta da bude izvršena ili ne.

http://www.fspro.net/hide-folders-xp/faq.html#HowWorks

To znaci da ako se ubije njegov proces, folder opet postaje dostupan.
To prakticno znaci da nema kvalitetnog nacina skrivanja foldera i zabrane gledanja njegovog sadrzaja osim enkripcije istog.

Uvek mozes da napises drajver koji ce da nadgleda pristup na nivou file sistema. Takodje druga mogucnost je postavljanje prava pristupa vezano za nalog korisnika. Sa pravima pristupa moze mnogo toga da se uradi, ali to radi samo ukoliko je file sistem ntfs.

Vise mi se svidja ova prva ideja s obzirom da bi dobro bilo da program radi i na FAT32.
I ako se loguje administrator opet moze sve da vidi, tako da je bolje da se napravi kao neki driver koji ce sve to da kontrolise.