Da nije možda do podešavanja u Pan&Scan? Pokušaj da u toku reprodukcije pritisneš 5 na numeričkoj tastaturi (to bi trebalo da vrati sliku na originalnu veličinu), a takođe možeš i desni klik negde preko slike pa u meniju potražiš Pan&Scan i pregledaš opcije. Malo mi je čudno da ti se to stalno dešava, jer bi Pan&Scan trebalo da se resetuje pri svakom novom pokretanju MediaPlayerClassic-a.

Resenje
View >> Video Frame >> Stretch to Window ( bilo je na normal size)