Ja sam imao slican problem.Napravio sam panele za svaku od recimo 5 mogucih opcija.Postavio ih na glavnu formu, jedan ispod drugog i jednostavno kad aktiviras iz menija neku opciju on samo odradi BringToFront().To ce ti medjutim znacajno uticati na perfomanse visual designer-a, ali ja sam ima relativno malo kontrola na svakom panelu.

Edit:
Mada posle jos jednog citanja tvoje poruke, mozda ovo resenje ipak nije ono sto tebi treba.

1. Napravite user kontorle, nabacajte komponente koje vam trebaju na njih, stavite tab page kontrolu kojima tabove mozete i dinamicki dodavati, u zavisnosti od akcije korisnika u meniju, kreirati instancu potrebne user kontrole i zalepiti je na kreirani tab.
2. Napraviti child prozore, koji mogu biti u kombinaciji sa user kontrolama - mozda malo nezgrapnije resenje...