Kada pravis butabilni USB stick, iz Ubuntu-a, uz pomoc programa

usb-creatror (usb-creator-gtk), imas opciju da se promene cuvaju
i da se za to odvoji mesta koliko zelis (ako imas USB od 1GB, mozes
maksimalno oko 200 i nesto MB, ako imas veci USB, mozes i vise).

U meniju je ovaj program kao "Startup Disk Creator", nalazi se u System --> Administration



Tako ce sve sto instaliras, podesis - biti sacuvano u tom zadatom postoru.