Rijndael je trenutni AES, dok DES i TripleDES su bivsi AES, sad zastareli, tako da bi preporucio Rijndael, kad je dobar za americku vladu bice dobar i tebi. :)

Imas jos i Twofish, brz i za sada siguran http://www.schneier.com/twofish.html. Twofish je naslednik popularnog blowfish algoritma. Ne znam za .Net implementaciju ali imas dll i PInvoke away.

Hm, ne znam kako i zasto, ali, kad sam pustio Rijndael i TripleDES bio dobio sam vreme da u sustini nekako TripleDES radi skoro 4 puta brze?

Pri svakoj enkripciji nije pitanje "da li" nego "kada", tj. sve zavisi od toga koliko dugo hoces da su ti podaci zasticeni. S obzirom na razvoj hardvera svaka danasnja enkripcija ce biti razbijena, samo je pitanje vremena. Ako ti je brzina enkriptovanja bitna korisiti 3DES ako si nasao da je brzi, ja sam ti samo naveo sta misle americki strucnjaci koji su ga odbacili u korist Rijndaela, mada daleko od toga da se 3DES vise ne koristi.