Nisi napisao koji operativni sistem je u pitanju.

Generalno za unixe je odgovor da može preko NFS-a. Ako ti treba još detalja, javi.

Za windoze nisam upoznat.

OS - Windows 2000

možda bi moglo i u windowsu sa mapiranjem mrežnih diskova (ne znam, ne razumem se), ali bi svakako moglo sa mysql replikacijom.

znači, ako imaš dva servera, A (apache, mysql server) i B (podaci za mysql server), onda možeš i na server B da instaliraš mysql server koji bi radio u "slave" modu za replikaciju, i koji bi preuzimao kod sebe sve izmene nad podacima izvršene na serveru A (gde mysql server podesiš da radi kao "master" za replikaciju).

Zanima me koji je razlog za instaliranje MySQL-a na jednoj masini
ako podaci treba da se nalaze na drugoj (mislim zasto ga ne
instalirati na toj masini)?? Sa mapiranjem mreznih diskova
dodatno usporavas server koji sada podatke treba da prenosi i
preko mreze (a mozda se lisavas kesiranja koje vrsi OS)
Kakve vezi imaju php i apache sa tvojim problemom??